Teste de associação marca-característica com correção por estrutura populacional e parentesco (modelo misto unificado), gráfico de Manhattan, gráfico Q-Q e fator de inflação genômica (λ) para verificar se a correção evitou falsos positivos.
Cada linha é um indivíduo/genótipo. Colunas de marcador: genótipo como contagem do alelo alternativo (0/1/2) — mínimo de 20 marcadores. Inclua uma coluna com o fenótipo observado e, opcionalmente, uma coluna de identificação.
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Aceita: .xlsx, .xls, .csv, .txt, .dbf
Selecione os marcadores (mín. 20) e o fenótipo, depois clique em Rodar GWAS.
Colunas de Marcador/Locus
Importe dados para ver as colunas.
Genótipos codificados como 0/1/2. Mín. 20 marcadores.
Fenótipo
Identificação (opcional)
Componentes principais (correção extra)
Modelo K já corrige por parentesco/estrutura. PCs adicionam correção extra (modelo P+K).
MAF mínima
Cuidado com falsos positivos
GWAS sem correção por parentesco/estrutura populacional infla falsos positivos. Este módulo sempre corrige por parentesco (matriz K); verifique o fator de inflação genômica (λ) antes de interpretar qualquer marcador como associado.